БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОВ АКТИНА α-1 ACTN1 - Студенческий научный форум

IX Международная студенческая научная конференция Студенческий научный форум - 2017

БИОИНФОРМАТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ГЕНОВ АКТИНА α-1 ACTN1

Иевлев Р.С. 1, Бородин В.А. 1, Демченко В.А. 1, Числов А.А. 1
1ФГБОУ ВО Волгоградский государственный медицинский университет
 Комментарии
Текст работы размещён без изображений и формул.
Полная версия работы доступна во вкладке "Файлы работы" в формате PDF
Актин - это белок мышечной ткани, полимеризованная форма которого образует микрофиламенты – один из основных компонентов цитоскелета эукариотических клеток. Актин совместно с другим белком – миозином – образует актомиозин – основной структурный элемент сократительных нитей мышечных волокон. Актин – водорастворимый глобулярный структурной белок с молекулярной масса 42000 Да, состоящий из 376 аминокислотных остатков. Существует две формы белка актина: глобулярная (G-актин) и фибриллярная (F-актин). Фибриллярная форма образуется при полимеризации глобулярного актина с образованием неорганического фосфата в присутствии АТФ и ионов магния Mg2+.

Актин присутствует в клетках всех эукариот и является, таким образом, одним из важнейших структурных белков. Однако у различных эукариотических организмов нуклеотидные последовательности одного и того же гена могут довольно сильно различаться. Также вероятно наличие некоторых высоко консервативных нуклеотидных последовательностей. В данной работе проведён биоинформатический анализ нуклеотидных последовательностей гена актина α-1 пяти эукариотических организмов: Человек разумный (Homo sapiens), Дикий бык (Bos taurus), Домовая мышь (Mus musculus), Курица (Gallus gallus) и Серая крыса (Rattus norvegicus). Проведено множественное выравнивание указанного гена при помощи программного обеспечения «UGENE-1.25.0». Результаты представлены на рис.1.

Рис. 1. Результаты множественного выравнивания гена актина α-1 Actn1.

Как видно из результатов множественного выравнивания, ген Actn1 характеризуется средней степенью гомологии в рамках данной выборки организмов. Стоит отметить, что каждый раз в разных положениях нуклеотидов наблюдается гомология между разными организмами, а не между одними и теми же на протяжении всей последовательности. Это свидетельствует о высокой степени консервативности данного гена.

Библиографический список:

1. Б. Альбертс, Д. Брей, Дж. Льюис, М. Рефф, К. Робертс, Дж. Уотсон, Молекулярная биология клетки — В 3-х т. — Пер. с англ. — Т.2. — М.: Мир, 1994. — 540 с.

2. Васильев Ю. М. Клетка как архитектурное чудо. Ч. 2. Цитоскелет, способный чувствовать и помнить // Соросовский Образовательный Журнал. 1999. №4. С. 4-10.

Просмотров работы: 888