Цель занятия: Ознакомить с классификацией хромосомных аберраций. Изучить клиническую характеристику хромосомных патологий. Ознакомится с принципами учета хромосомных аберраций у пациентов.
Ход занятия:
Работа №1. Изучение классификации хромосомных аберраций.
Задание: Записать определения к себе в тетрадь.
Хромосомные аберрации – это структурные и числовые аномалии хромосом, регистрируемые в метафазе клеточного деления.
Классификация хромосомных аберраций
1) По времени возникновения в процессе клеточного деления:
- Аберрации хромосомного типа. Возникают при повреждении хромосомы на предсинтетической стадии (G1-фаза), когда хромосома реагирует как однонитчатая структура.
- Аберрации хроматидного типа. Возникает при повреждении хромосомы на стадии двух нитей (S- и G2- фазы).
2) По причине возникновения:
- Спонтанные. Причина возникновения мутаций неизвестна.
- Индуцированные. Возникают под действием мутагенных факторов.
3) По типу клеток, в которых они располагаются:
- В гаметах. Хромосомные аберрации передаются следующим поколениям.
- В соматических клетках.
4) По изменению числа или структуры хромосом:
- Геномные мутации – изменение числа хромосом
- Хромосомные мутации – изменение структуры хромосом
5) По способности передаваться в ряду клеточных поколений:
- Стабильные аберрации – хромосомы с одной центромерой, способные дуплицироваться и прикрепляться к веретену деления. Осложнения в клеточном делении отсутствуют, так как данные аберрации могут передаваться в ряду клеточных поколений. Обе дочерние клетки содержат данный тип аберрации.
- Нестабильные аберрации – хромосомные аберрации, которые не передаются в ряду клеточных поколений. В первом случае хромосомы не способны прикрепляться к веретену деления, так как в своей структуре не содержат центромеры. Такие хромосомы называются ацентрическими. В процессе деления клетки могут оставаться только в одной дочерней клетке или быть утеряны.
Во втором случае хромосомы препятствуют делению клетки, так как являются полицентрическими. Веретено деления, прикрепившееся к данной хромосоме с разных полюсов клетки, препятствует цитокенезу.
Работа №2. Изучение морфоструктуры хромосомных аберраций.
Задание: Используя учебник, распределите нижеуказанные типы хромосомных аберраций на стабильные и нестабильные.
Типы хромосомных аберраций |
Стабильные хромосомные аберрации |
Нестабильные хромосомные аберрации |
Дицентрические хромосомы |
||
Ацентрические кольца |
||
Центрические кольца |
||
Хромосома с инсерцией |
||
Полицентрические хромосомы |
||
Центрический фрагмент |
||
Ацентрический фрагмент |
||
Хромосома с дупликацией |
||
Парацентрические инверсии |
||
Перицентрические инверсии |
||
Изохромососма |
||
Реципрокные транслокации |
||
Нереципрокные транслокации |
||
Робертсоновские транслокации |
||
Анафазные мосты |
Работа №3. Геномные мутации.
Задание: Заполнить таблицу, вписав в нее нижеуказанные синдромы. Какой синдром нельзя включить в данную таблицу и почему?
Синдромы: триплоидия, синдром Шерешевского-Тернера, синдром Джейкоба, синдром Варкани, Синдром Патау, синдром Эдвардса, синдром Дауна, синдром кошачьего крика, синдромы Клайнфельтера, синдром трипло-Х.
Тип геномной мутации |
Синдром |
Возможные кариотипы |
Фенотип |
|
Полиплоидии |
||||
Анеу-плоидии |
Нулисомия (2n – 2) |
|||
Моносомия (2n – 1) |
||||
Полисомия (2n + с) |
Работа №4. Принципы учета хромосомных аберраций.
Задание: Рассмотреть под микроскопомметафазные пластинки человека. Ознакомится с принципами учета хромосомных аберраций у пациентов при анализе цитологических препаратов. Ответить на вопрос: Какие клетки используют для цитогенетического анализа?
Рис. 1: Протокол цитогенетического исследования.
Правила анализа цитологического препарата:
1) Учитываются метафазные пластинки, на которых хромосомы хорошо прокрашены и равномерно разбросаны.
2) Недопустимо наличие случайных хромосом в поле зрения.
3) Учитываются пределы уровня конденсации хромосом.
4) Хромосомы не налегают друг на друга.
Данные цитогенетических исследований заносят в специальные бланки-протоколы (Рис. 1). Каждый из прямоугольников на бланке соответствует одной проанализированной клетке. В них отмечается число хромосом и координаты пластинки. Если имеется аберрация, то ее схематически зарисовывают. Клетки без аберраций обозначаются символом «N».
При завершении анализа препарата в бланк заносят основные показатели: общее число проанализированных клеток, число клеток с аберрациями хромосом, общее число аберраций, общее число поврежденных хромосом, типы аберраций.
Работа №5. Цитогенетические методы изучения хромосом.
Задание: Прочитать и записать основную суть представленных методов изучения хромосом.
Цитогенетические методы исследования хромосом связаны, прежде всего, с микроскопическими методами изучения хромосом. При этом исследуемым материалом могут послужить клетки костного мозга, лимфоциты, фибробласты, клетки кожи, регенерирующей печени.
В настоящий момент для упрощения исследований, используют специальные обработки культур исследуемых клеток. Так, например, обработка клеток алкалоидом колхицином, ведет к накоплению делящихся клеток на стадии метафазы, а обработка клеток слабыми растворами определенных солей вызывает набухание и расправление хромосом.
Рис. 2: Чередование бэндов в хромосоме Х, полученное разными методами дифференциальной окраски.
Метод дифференциальной окраски позволяет идентифицировать каждую хромосому. Существует множество методов окраски (Q-окраска, С-окраска и другие). Наиболее распространённым методом окраски в клинических лабораториях является окраска методом Гимзы (G-окраска). G-окраска выявляется благодаря предварительной обработке хромосомных препаратов слабым раствором трипсина и последующей окраске красителем Гимза. При этом наблюдается полосатая исчерченность хромосом, где темные полосы соответствуют гетерохроматиновым районам, а светлые - эухроматиновым.
Метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) используют как для определения инфекционных и вирусных заболеваний, так и для поиска хромосомных аномалий. С помощью специального фермента ДНК-полимеразы в искусственных условиях увеличивают в объеме имеющийся ДНК материал. После этого исследуемый ген секвенируют для определения мутаций.
Секвенирование – техника определения нуклеотидной последовательности ДНК и РНК для получения формального описания её первичной структуры. Современные методы секвенирования: 454 Life Sciences, Illumina-SOLEXA, IonTorrent, SOLiD, Helicos. Общий план процедуры секвенирования делится на 3 этапа:
Создание библиотеки случайных последовательностей ДНК, которые можно будет сшить с общедоступными адаптерными последовательностями.
Увеличение числа копий генов с помощью ПЦР, которые будут использованы как образцы.
Определение первичной структуры всех фрагментов.
С развитием данного метода, стали доступны геномы разных по сложности живых систем: от микроорганизмов до человека. Секвенирование определенных регионов в геномах используется для выявления полиморфизмов и мутаций в генах.
Рекомендованная литература для подготовки к занятию:
1. Бочков, Н. П. Клиническая генетика: учебник с приложением на компакт диске / Н. П. Бочков. - 4-е изд., испр. и доп. – М: ГЭОТАР- Медиа, 2013. - 592 с. (2014) 2015
2. Мутовин, Г. Р. Клиническая генетика. Генодинамика и протеомика наследственной патологии: учебное пособие / Г. Р. Мутовин. - 3-е изд., испр. и доп. - Москва: ГЭОТАР-Медиа, 2010. – 832 с.
Контроль теоретических знаний студентов:
I вариант:
1 вопрос: Назовите типы анеуплоидии с данными кариотипами:
а) 47, XXY б) 2n – 1
2 вопрос: Назовите синдромы с данными кариотипами:
а) 47, +13 б) 47, ХХ+21/ 46 ХХ
3 вопрос: Выберите из нижеперечисленных аберраций стабильные:
а) центрический фрагмент б) изохромосома
II вариант:
1 вопрос: Назовите типы анеуплоидии с данными кариотипами:
а) 46 / 47, +8 б) 2n – 2
2 вопрос: Назовите синдромы с данными кариотипами:
а) 47, +18 б) 46, t (14,21)
3 вопрос: Выберите из нижеперечисленных аберраций стабильные:
а) анафазный мост б) робертсоновская транслокация
Использованные материалы, для подготовки методического пособия:
1. Захаров А.Ф. и др. Хросмосомы человека. М.: Медицина, 1982. 264 с.
2. http://www.studfiles.ru/preview/2362151/page:2/
3. https://worldwide.promega.com/products/next-generation-sequencing/
4. http://megapredmet.ru/1-84538.html
5. https://ru.wikipedia.org/wiki/Методы_секвенирования_нового_поколения